Тестът се използва за диагноза на възпалителните заболявания на дебелото черво (IBD) и по-специално за диференциация между улцерозен колит и болестта на Крон.
Тези две заболявания се диагностицират най-често между 15 и 30 год. възраст, със втoри пик на 50-55 год. възраст. Срещат се по целия свят, но значимо по-висока честота се наблюдава във високо индустриализираните страни. В етиологията на тези заболявания участват три групи фактори- генетична предиспозиция, дисрегулиран имунен отговор и увреден отговор към собствената чревна микрофлора, както и влияние на фактори от околната среда (тютюнопушене, прах, стрес, микроби).
ASCA са силно свързани с болестта на Крон.
Доказано е, че имунната дисфункция при болестта на Крон е свързана с активация на Th-1 лимфоцити, повишена секреция на IL-12, TNFα, IFNʏ в отговoр на бактериални антигени, както и повишена резистентност към апоптоза, което поддържа възпалителните процеси.